Pramení v Novohradských horách několika potoky, z nichž hlavní vstupuje na naše území z Rakouska pod kopcem Kamenec. Všeobecně teče severovýchodním směrem, do Malše se vlévá pod Kaplicí. Plocha povodí Černé činí necelých 150 km2. Délka sjížděného toku je 17 km.

Řečiště je úzké, s velkým spádem a ostrými zákruty. Břehy, které byly dříve upraveny pro plavení dřeva, jsou dnes neudržované, postupným rozpadem technických staveb (výdřeva břehů, podlahy a pod.) vznikají nové peřeje a voda podemílá břehy, což činí plavbu po Černé velmi náročnou. Nejtěžší úsek je pod Soběhovskou nádrží, kde řeka tvoří v místech někdejších propustí kaskády a celý úsek dlouhý 3 km má veliký spád a proto i velkou rychlost proudu.